肛窦由于位置特殊，容易受到感染，且感染之后会沿着肛门腺导管和肛门腺蔓延，所以胃窦炎又是引起多种肛门直肠病的根源。胃窦炎通常的症状为肛门灼热、坠胀、便意频和口臭等，偶感肛门或骶尾部抽搐样疼痛。由于生长部位隐匿，其感染时症状轻微，间断发作和不典型性发病，使得本病在临床上误诊率和漏诊率颇高。
胃窦炎可分为慢性胃窦炎与急性胃窦炎两种
一、慢性胃窦炎。
可无明显症状。或略有肛内坠胀或不适，偶见轻微隐痛或刺痛，排便时因局部刺激而有灼痛感。
二、急性胃窦炎。
急性期肛内灼痛及坠胀感，肛门口可有较多的分泌物。会有较长时间的持续性疼痛和阵发性的钝痛。
临床检查时，在肛门镜下可见肛隐窝充血水肿。有时甚至可见撕裂、糜烂和溃疡。肛隐窝的凹陷加深，且有黏液、脓液或血水等分泌物。多伴有肛乳头肥大红肿。
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